二代健保新制於100年1月26日修正公布全民健康保險法，並於102年1月1日實施。期間，在本局同仁全面積極宣導說明，暨各界及媒體先進持續關心協助下，截至目前，補充保險費繳納情形尚符預期，在此感謝所有扣費義務人的全力配合，也謝謝財政部、金管會等部會的協助。 

二代健保新制實施第一年，以2%補充保險費率計收補充保險費，預估收入約206億元，而由於股利所得集中於6月~8月配發、超過投保金額4倍之獎金多於1月~2月發放，以及2萬元以下利息所得，係於次年1月底前始由健保局開單收取等因素，以致於補充保險費收繳金額會產生季節性、週期性的變化。 

為了減少對民眾之影響，補充保險費之計收，採就源扣繳方式，由扣費義務人於給付時，依規定之補充保險費率扣取補充保險費，並於給付日之次月底前向保險人繳納，並得寬限15日。經統計102年1月1日至3月14日，二個半月時間，補充保險費收繳約26.8億元，目前整體繳納情形尚符預期，本局仍將持續宣導，並以保守謹慎態度密切觀察後續情形。