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• 衛生福利部113年9月12日函修訂「法定傳染病醫療服務費用支付作業規範」，自113年10月1日起適用
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• 疾病管制署檢送「113-114年COVID-19 JN.1疫苗接種計畫」，自113年10月1日起生效
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• 疾病管制署檢送「113年度流感疫苗接種計畫」之接種處置費申報及核付作業，自113年10月1日起生效
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• 疾病管制署修訂「孕婦全面篩檢愛滋病毒計畫」之法定傳染病醫療服務費用支付作業規範，自113年10月1日起生效
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• 疾病管制署檢送113年流感疫苗接種計畫及工作手冊修正重點
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• 疾病管制署修訂「112年度流感疫苗接種計畫」之接種處置費申報及核付作業，自113年3月5日起生效
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• 疾病管制署檢送113年「兒童常規疫苗 」 及 「 65 歲以上長者(含55-64歲原住民肺炎鏈球菌疫苗)」接種處置費補助作業計畫修訂版，自113年1月9日起生效
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• 衛生福利部112年12月29日函修訂「法定傳染病醫療服務費用支付作業規範」，自113年1月1日起適用
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• 衛生福利部112年9月27日函修訂「法定傳染病醫療服務費用支付作業規範」，自112年10月1日起適用
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• 112年9月8日衛生福利部疾病管制署修訂「性傳染病、急性病毒性肝炎或藥癮病患全面篩檢愛滋病毒計畫」，自112年10月1日起實施
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• 112年9月5日衛生福利部疾病管制署修訂衛生福利部中央健康保險署行政協助疾病管制署辦理「112年度流感疫苗接種計畫」之接種處置費申報及核付作業，自112年10月2日起實施
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• 112年8月30日疾病管制署函修訂衛生福利部中央健康保險署代辦「登革熱NS1抗原快速診斷試劑」 之費用申報及核付作業
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• 112年1月18日疫情指揮中心函自112年1月1日起調整COVID-19確診者隔離治療費用支付對象一事，補充說明相關作業
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• 111年12月28日疫情指揮中心函自112年1月1日起調整COVID-19確診者隔離治療費用支付對象(詳附檔)
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• 衛生福利部111年12月22日函修訂「法定傳染病醫療服務費用支付作業規範」，自112年1月1日起適用
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• 疾管署修訂「兒童常規疫苗」及「71歲以上長者肺炎鏈球菌疫苗」接種處置費補助作業計畫(疾管署111.11.16函)
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• 111年度流感疫苗接種計畫之接種處置費申報及核付作業(疾管署111.09.15函)
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• 疾病管制署檢送111年「兒童常規疫苗」及「71歲以上長者肺炎鏈球菌疫苗」接種處置費補助作業計畫修訂版
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• 衛生福利部疾病管制署委託代辦之三項愛滋篩檢計畫(案件分類B1、B9及BA)，自111年4月1日起增訂檢驗項目「人類免疫缺乏病毒抗原及抗體複合型試驗(HIV Ag/Ab Combo test)」、醫令代碼E3046C、支付點數280點
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• 修訂110年度流感疫苗接種計畫之接種處置費健保卡資料登錄/上傳與申報及核付作業
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• 衛生福利部法定傳染病醫療服務費用支付作業規範1110101起適用
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• 110年度流感疫苗接種計畫之接種處置費健保卡資料登錄/上傳與申報及核付作業（110.10.01修訂版）
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• 109年度流感疫苗接種計畫之接種處置費健保卡資料登錄/上傳與申報及核付作業（110.01.25修訂版）
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• 衛生福利部法定傳染病醫療服務費用支付作業規範1100101起適用
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• 109年度流感疫苗接種計畫之接種處置費健保卡資料登錄/上傳與申報及核付作業(109.10.12新增)
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• 衛生福利部法定傳染病醫療服務費用支付作業規範1081101起適用
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• 衛生福利部法定傳染病醫療服務費用支付作業規範(自108.01.01起生效)(108.01.07新增)
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• 衛生福利部法定傳染病醫療服務費用支付作業規範(自107.09.01起生效)(107.09.04新增)
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• 1070901修正兒童常規疫苗及75歲者者肺炎鏈球菌疫苗接種處置費相關作業規定(107.08.28新增)
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• 衛生福利部法定傳染病醫療服務費用支付作業規範(自107.04.01起生效)(107.03.29新增)
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• 自104年1月1日起取消公務預算支付「抗結核藥物副作用個案住院≦30天之醫療費用(C3案件)(103.12.03新增)
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• 有關法定傳染病「新型A型流感」隔離治療費用之申報、核付及審查作業」(103.07.29新增)
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• 衛生福利部法定傳染病醫療服務費用支付作業規範(自106.02.04起生效)(106.02.09更新)
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• 自103年2月1日起取消公務預算支付「痰抹片陽性個案住院小於等於14天之醫療費用(C2案件)」(102.12.31新增)
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